ارتباط مستقیم با کارشناس فروش
DNA Ladder چیست؟ راهنمای انتخاب لدر 50bp، 100bp و 1kb
DNA Ladder چیست؟ راهنمای انتخاب لدر 50bp، 100bp و 1kb
DNA Ladder یا DNA Marker یکی از مواد مصرفی مهم در الکتروفورز ژل است که برای تخمین اندازه قطعات DNA استفاده میشود. وقتی محصول PCR، قطعه حاصل از هضم آنزیمی یا DNA موردنظر روی ژل آگارز قرار میگیرد، از روی یک باند بهتنهایی نمیتوان فهمید که طول آن چند جفتباز است. در این شرایط، DNA Ladder مانند یک خطکش مولکولی در کنار نمونه قرار میگیرد و با مقایسه موقعیت باندها میتوان اندازه تقریبی DNA را مشخص کرد.
انتخاب DNA Ladder باید بر اساس اندازه مورد انتظار قطعه انجام شود. برای قطعات کوچک میتوان از Eco 50bp یا 50bp DNA Ladder استفاده کرد، برای بسیاری از محصولات PCR، 100bp DNA Ladder انتخاب مناسبی است و برای قطعات بزرگتر و چند کیلوبازی، 1kb DNA Ladder کاربرد بیشتری دارد.
در این مقاله با مفهوم DNA Ladder، DNA Marker، لدر 50bp، لدر 100bp، لدر 1kb، Eco 50bp و روش انتخاب بهترین DNA Ladder برای آزمایش آشنا میشوید.
DNA Ladder چیست؟
DNA Ladder مجموعهای از قطعات DNA با اندازههای مشخص و شناختهشده است که بهعنوان استاندارد اندازه در الکتروفورز مورد استفاده قرار میگیرد.
این قطعات هنگام عبور از ژل بر اساس اندازه خود از یکدیگر جدا میشوند. قطعات کوچکتر معمولاً سریعتر از قطعات بزرگتر در ژل حرکت میکنند. بنابراین پس از پایان الکتروفورز، باندهای DNA Ladder در موقعیتهای مختلف دیده میشوند و میتوان باند نمونه را با باندهای شناختهشده لدر مقایسه کرد.
برای مثال، اگر محصول PCR شما در نزدیکی باند 500 bp در DNA Ladder قرار داشته باشد، میتوان اندازه آن را حدود 500 جفتباز در نظر گرفت.
بنابراین بهصورت ساده:
DNA Ladder = استاندارد اندازه قطعات DNA در الکتروفورز
DNA Ladderها در اندازهها و الگوهای مختلف تولید میشوند و انتخاب آنها باید با محدوده اندازه قطعه مورد بررسی هماهنگ باشد. تولیدکنندگان تخصصی نیز DNA Ladderهای مختلفی از محدودههای چند ده جفتبازی تا دهها کیلوباز ارائه میکنند.
DNA Marker چیست؟
DNA Marker اصطلاح دیگری است که برای نشانگر اندازه DNA استفاده میشود. در بسیاری از آزمایشگاهها، عبارتهای DNA Marker و DNA Ladder برای یک کاربرد مشابه به کار میروند.
DNA Marker شامل قطعات DNA با اندازه مشخص است و به محقق اجازه میدهد اندازه تقریبی قطعه ناشناخته را با یک استاندارد مقایسه کند.
عبارتهای زیر نیز ممکن است برای همین مفهوم استفاده شوند:
- DNA Ladder
- DNA Marker
- DNA Size Marker
- Molecular Weight Marker
- DNA Molecular Weight Marker
- لدر DNA
- مارکر DNA
- مارکر وزن مولکولی DNA
بنابراین اگر در یک پروتکل آزمایشگاهی عبارت DNA Marker یا DNA Ladder را مشاهده کردید، در بسیاری از موارد منظور همان استاندارد اندازه DNA برای الکتروفورز است.
DNA Ladder چه کاربردی دارد؟
مهمترین کاربرد DNA Ladder، تخمین اندازه قطعات DNA روی ژل است؛ اما استفاده از آن به PCR محدود نمیشود.
1. بررسی اندازه محصول PCR
یکی از رایجترین کاربردهای DNA Ladder، بررسی محصولات PCR است.
فرض کنید بر اساس طراحی پرایمر انتظار دارید محصول PCR شما 500 bp باشد. بعد از PCR، نمونه را روی ژل آگارز بارگذاری میکنید و DNA Ladder را نیز در یک چاهک جداگانه قرار میدهید.
اگر باند نمونه در نزدیکی باند 500 bp لدر مشاهده شود، میتوان اندازه محصول را با نمونه استاندارد مقایسه کرد.
2. بررسی قطعات حاصل از هضم آنزیمی
در آزمایشهای Restriction Enzyme Digestion ممکن است یک DNA به چند قطعه تبدیل شود. DNA Ladder برای تخمین اندازه این قطعات نیز استفاده میشود.
3. بررسی محصولات کلونینگ
در آزمایشهای کلونینگ، بررسی پلاسمید و سایر روشهای مهندسی ژنتیک، مقایسه باندهای نمونه با DNA Marker میتواند برای بررسی اندازه قطعات مفید باشد.
4. بررسی قطعات DNA در ژل آگارز
DNA Ladder یکی از اجزای رایج آزمایشهای الکتروفورز ژل آگارز است و بهعنوان مرجع اندازه در کنار نمونهها قرار میگیرد.
DNA Ladder چگونه اندازه قطعات DNA را مشخص میکند؟
DNA دارای بار منفی است و در میدان الکتریکی به سمت قطب مثبت حرکت میکند. در ژل، حرکت قطعات DNA به اندازه و شرایط الکتروفورز وابسته است.
قطعات کوچکتر معمولاً راحتتر از منافذ ژل عبور کرده و مسافت بیشتری طی میکنند، در حالی که قطعات بزرگتر مسافت کمتری را طی میکنند.
به همین دلیل، پس از اجرای ژل میتوان موقعیت باند نمونه را با موقعیت باندهای DNA Ladder مقایسه کرد.
نکته مهم این است که DNA Ladder اندازه دقیق توالی DNA را تعیین نمیکند؛ بلکه امکان تخمین اندازه قطعه بر اساس مقایسه با استانداردهای شناختهشده را فراهم میکند.
چگونه DNA Ladder مناسب انتخاب کنیم؟
مهمترین معیار در انتخاب DNA Ladder، اندازه مورد انتظار قطعه DNA است.
قبل از خرید یا استفاده از DNA Marker بهتر است بدانید محصول شما تقریباً چه اندازهای دارد.
بهصورت ساده:
| اندازه تقریبی قطعه DNA | گزینه مناسب |
|---|---|
| 50 تا 500 bp | Eco 50bp |
| 50 تا 1000 bp | 50bp DNA Ladder |
| 100 تا 1500 bp | 100bp DNA Ladder |
| 1000 تا 10000 bp | 1kb DNA Ladder |
البته این تقسیمبندی یک راهنمای عملی است و شرایط ژل، درصد آگارز و میزان تفکیک موردنیاز نیز باید در نظر گرفته شود.
لدر 50bp چیست؟
50bp DNA Ladder برای بررسی قطعات DNA کوچک طراحی شده است.
لدر 50bp یکتا تجهیز آزما از 13 قطعه DNA در محدوده 50 تا 1000 جفتباز تشکیل شده است. باندهای 250 و 500 bp بهعنوان باندهای مرجع در نظر گرفته شدهاند تا شناسایی الگوی لدر روی ژل سادهتر شود. این محصول بهصورت آماده استفاده ارائه میشود.
بنابراین لدر 50bp برای آزمایشهایی که محصول DNA در محدوده کوچک تا متوسط قرار دارد، انتخاب مناسبی است.
50bp-DNA-lader-yektatajhiz
لدر 50bp برای چه آزمایشهایی مناسب است؟
از این DNA Marker میتوان برای مواردی مانند:
- بررسی محصولات PCR
- بررسی قطعات DNA کوچک
- بررسی محصولات هضم آنزیمی
- الکتروفورز ژل آگارز
- برخی کاربردهای ژل پلیآکریلآمید
استفاده کرد.
نکته مهم: عدد 50bp در نام محصول به فاصله و الگوی اندازهگذاری لدر اشاره دارد و به این معنی نیست که این محصول فقط برای قطعه 50 bp استفاده میشود.
لدر 50bp یکتا تجهیز آزما محدوده 50 تا 1000 bp را پوشش میدهد.
Eco 50bp DNA Ladder چیست؟
Eco 50bp DNA Ladder گزینهای برای زمانی است که بیشتر با قطعات DNA کوچکتر سروکار دارید.
Eco 50bp DNA Ladder یکتا تجهیز آزما شامل 8 باند در محدوده 50 تا 500 bp است و باندهای 250 و 500 bp بهعنوان باندهای مرجع در آن مشخص شدهاند. این محصول نیز بهصورت آماده استفاده عرضه میشود.
Eco 50bp DNA Ladder
تفاوت Eco 50bp با 50bp DNA Ladder چیست؟
مهمترین تفاوت این دو محصول، محدوده اندازهای آنها است.
- Eco 50bp: از 50 تا 500 bp
- 50bp DNA Ladder: از 50 تا 1000 bp
بنابراین اگر محصول PCR شما در محدوده 50 تا 500 bp قرار دارد و به همین بازه نیاز دارید، Eco 50bp گزینه مناسبی است.
اگر احتمال میدهید محصول شما تا 1000 bp باشد، استفاده از 50bp DNA Ladder پوشش بیشتری در اختیار شما قرار میدهد.
لدر 100bp چیست؟
100bp DNA Ladder یکی از پرکاربردترین DNA Markerها برای بررسی قطعات DNA در محدوده محصولات PCR رایج است.
لدر 100bp یکتا تجهیز آزما شامل 11 قطعه DNA است:
100، 200، 300، 400، 500، 600، 700، 800، 900، 1000 و 1500 bp
باندهای 500 و 1500 bp بهعنوان باندهای مرجع طراحی شدهاند و محصول بهصورت آماده استفاده ارائه میشود.
این ساختار باعث میشود بتوان محصولات DNA را در محدوده 100 تا 1000 bp با فواصل منظم 100 جفتبازی مقایسه کرد.
100bp DNA Ladder
لدر 100bp برای چه محصولاتی مناسب است؟
برای مثال اگر محصول PCR شما حدود:
- 200 bp
- 300 bp
- 500 bp
- 700 bp
- 900 bp
- 1000 bp
- 1500 bp
باشد، لدر 100bp میتواند گزینه مناسبی برای مقایسه اندازه باشد.
لدر 1kb چیست؟
1kb DNA Ladder برای بررسی قطعات DNA بزرگتر و چند کیلوبازی استفاده میشود.
لدر 1kb یکتا تجهیز آزما از 8 قطعه DNA تشکیل شده است:
1000، 2000، 3000، 4000، 5000، 6000، 8000 و 10000 bp
باند 4000 bp بهعنوان باند مرجع با شدت بالاتر در نظر گرفته شده است و محصول بهصورت آماده استفاده ارائه میشود.
بنابراین اگر اندازه قطعه شما چند کیلوباز باشد، لدر 1kb انتخاب منطقیتری نسبت به لدرهای مخصوص قطعات کوچک است.
1kb DNA Ladder
لدر 1kb برای چه آزمایشهایی مناسب است؟
این DNA Ladder میتواند برای موارد زیر استفاده شود:
- بررسی قطعات DNA چند کیلوبازی
- محصولات PCR با اندازه بزرگ
- بررسی قطعات حاصل از هضم آنزیمی
- بررسی DNA در ژل آگارز
- بررسی برخی محصولات کلونینگ و مهندسی ژنتیک
تفاوت لدر 50bp، 100bp و 1kb چیست؟
تفاوت اصلی این سه محصول در محدوده اندازه قطعات و فاصله بین باندهای لدر است.
| تفاوت ها | 50bp | 100bp | 1kb |
|---|---|---|---|
| محدوده محصول یکتا تجهیز | 50–1000 bp | 100–1500 bp | 1000–10000 bp |
| کاربرد اصلی | قطعات کوچک | قطعات کوچک تا متوسط | قطعات بزرگ |
| تعداد باند | 13 | 11 | 8 |
| باندهای مرجع | 250 و 500 bp | 500 و 1500 bp | 4000 bp |
| مناسب برای PCR | بله | بله | برای محصولات بزرگتر |
این مشخصات بر اساس اطلاعات فعلی محصولات یکتا تجهیز آزماست.
تفاوت لدر 50bp و 100bp چیست؟
این سؤال یکی از مهمترین پرسشها هنگام انتخاب DNA Ladder است.
در لدر 50bp، فاصله اندازهای بین بسیاری از باندها کمتر است و از 50 bp شروع میشود. در لدر 100bp، باندهای اصلی از 100 bp با فاصلههای 100 جفتبازی قرار گرفتهاند.
بنابراین:
برای قطعات کوچکتر و زمانی که تفکیک اندازه در محدوده پایین اهمیت بیشتری دارد → 50bp
برای بسیاری از محصولات PCR در محدوده 100 تا 1000 bp → 100bp
البته انتخاب نهایی به اندازه مورد انتظار محصول و میزان تفکیک موردنیاز بستگی دارد.
تفاوت لدر 100bp و 1kb چیست؟
لدر 100bp برای قطعاتی طراحی شده که عمدتاً در محدوده صدها جفتباز تا حدود 1.5 kb قرار دارند، در حالی که لدر 1kb برای قطعات بزرگتر در مقیاس چند کیلوباز استفاده میشود.
مثلاً اگر محصول شما حدود 400 bp باشد، لدر 100bp انتخاب طبیعیتری است.
اگر محصول حدود 4 kb باشد، لدر 1kb انتخاب مناسبتری خواهد بود.
برای PCR چه DNA Ladder انتخاب کنیم؟
برای انتخاب DNA Ladder در PCR، ابتدا اندازه تقریبی محصول مورد انتظار را مشخص کنید.
محصول PCR حدود 100 تا 500 bp
میتوانید از Eco 50bp، 50bp یا 100bp استفاده کنید.
اگر تمرکز شما روی قطعات بسیار کوچک است، Eco 50bp یا 50bp انتخاب مناسبی است.
محصول PCR حدود 500 تا 1000 bp
50bp یا 100bp DNA Ladder میتواند مناسب باشد.
محصول PCR حدود 1000 تا 1500 bp
100bp DNA Ladder گزینه مناسبی است.
محصول PCR چند کیلوبازی
اگر محصول چندین کیلوباز طول دارد، 1kb DNA Ladder انتخاب مناسبتری است.
برای ژل آگارز چه DNA Ladder انتخاب کنیم؟
انتخاب DNA Ladder به اندازه DNA مورد انتظار بستگی دارد، نه صرفاً به نوع ژل.
اگر نمونه شما قطعهای کوچک در محدوده چند صد جفتباز است، لدرهای 50bp یا 100bp مناسب هستند.
اگر نمونه در محدوده 1 تا 10 kb قرار دارد، لدر 1kb انتخاب مناسبتری خواهد بود.
همچنین درصد آگارز باید متناسب با محدوده اندازه قطعات انتخاب شود؛ زیرا تفکیک قطعات DNA در ژل به شرایط الکتروفورز نیز وابسته است.
آیا هر DNA Ladder برای هر ژلی مناسب است؟
خیر.
برای رسیدن به تفکیک مناسب، باید چند عامل را همزمان در نظر گرفت:
اندازه قطعه DNA
مهمترین عامل، محدوده اندازه نمونه است.
درصد آگارز
درصد آگارز باید با اندازه قطعات مورد بررسی هماهنگ باشد.
ولتاژ الکتروفورز
ولتاژ نامناسب میتواند روی کیفیت تفکیک باندها تأثیر بگذارد.
زمان الکتروفورز
اجرای بسیار کوتاه یا بسیار طولانی ژل میتواند تشخیص باندها را دشوار کند.
کیفیت بافر
ترکیب و وضعیت بافر نیز بر حرکت DNA تأثیر دارد. تغییر در pH یا غلظت یونی میتواند الگوی مهاجرت را تغییر دهد.
بنابراین اگر باندهای DNA Ladder واضح نیستند، همیشه مشکل از خود لدر نیست و باید شرایط کامل الکتروفورز بررسی شود.
DNA Ladder آماده استفاده چیست؟
برخی DNA Ladderها بهصورت Ready-to-Use یا آماده استفاده عرضه میشوند. در این محصولات، کاربر میتواند لدر را طبق دستورالعمل مستقیماً برای بارگذاری روی ژل آماده کند.
مزیت این نوع محصولات کاهش مراحل آمادهسازی و سادهتر شدن روند کار آزمایشگاهی است.
محصولات لدر یکتا تجهیز آزما شامل 50bp، 100bp و 1kb بهصورت آماده استفاده معرفی شدهاند.
آیا DNA Ladder فقط برای اندازهگیری اندازه DNA است؟
کاربرد اصلی DNA Ladder، تخمین اندازه قطعات DNA است.
برخی DNA Ladderها علاوه بر اندازه قطعات، اطلاعات مربوط به مقدار DNA هر باند را نیز ارائه میکنند و در شرایط مشخص میتوان از شدت باندها برای تخمین تقریبی مقدار DNA استفاده کرد. با این حال، DNA Ladder را نباید با ابزارهای اختصاصی اندازهگیری غلظت DNA یکسان دانست.
بهصورت ساده:
DNA Ladder → مرجع اندازه و در برخی محصولات، تخمین تقریبی مقدار
روشهای اختصاصی سنجش غلظت → اندازهگیری غلظت DNA
DNA Ladder را در کدام چاهک ژل قرار دهیم؟
DNA Ladder معمولاً در یک چاهک جداگانه و در کنار نمونههای آزمایش قرار میگیرد.
برای مثال:
Lane 1 → DNA Ladder
Lane 2 → Sample 1
Lane 3 → Sample 2
Lane 4 → Sample 3
با این کار میتوان باندهای نمونه را با باندهای شناختهشده DNA Ladder مقایسه کرد.
البته تعداد چاهکها و ترتیب نمونهها به طراحی آزمایش بستگی دارد.
چه مقدار DNA Ladder روی ژل بارگذاری کنیم؟
مقدار مناسب بارگذاری به نوع محصول، غلظت Ladder، نوع ژل و دستورالعمل سازنده بستگی دارد.
برای نمونه، یکتا تجهیز آزما برای لدر 1kb مقدار 2 تا 5 میکرولیتر را برای هر چاهک پیشنهاد کرده است.
برای لدرهای دیگر نیز بهتر است همیشه دستورالعمل همان محصول بررسی شود و مقدار بارگذاری صرفاً بر اساس یک محصول دیگر تعیین نشود.
اگر باند DNA Ladder واضح نباشد چه کنیم؟
اگر باندهای Ladder کمرنگ، پخش یا غیرطبیعی هستند، موارد زیر را بررسی کنید:
- مقدار DNA Ladder کافی بوده است؟
- ژل با درصد مناسب تهیه شده است؟
- بافر تازه و با ترکیب صحیح استفاده شده است؟
- ولتاژ الکتروفورز مناسب بوده است؟
- زمان اجرای ژل مناسب بوده است؟
- سیستم تصویربرداری و رنگآمیزی درست عمل میکند؟
- شرایط نگهداری DNA Ladder مطابق دستورالعمل محصول بوده است؟
در بسیاری از موارد، کیفیت نامناسب باندها نتیجه شرایط الکتروفورز یا تصویربرداری است و لزوماً نشاندهنده مشکل در DNA Ladder نیست.
محصولات DNA Ladder یکتا تجهیز آزما
یکتا تجهیز آزما چند گزینه برای انتخاب DNA Ladder در اختیار کاربران قرار میدهد که میتوان آنها را بر اساس اندازه قطعه انتخاب کرد.
50bp DNA Ladder
محدوده: 50 تا 1000 bp
دارای 13 باند و باندهای مرجع 250 و 500 bp. مناسب برای بررسی قطعات کوچک DNA و محصولات PCR.
Eco 50bp DNA Ladder
محدوده: 50 تا 500 bp
دارای 8 باند و باندهای مرجع 250 و 500 bp؛ گزینهای مناسب برای تمرکز روی قطعات کوچکتر.
100bp DNA Ladder
محدوده: 100 تا 1500 bp
دارای 11 باند و باندهای مرجع 500 و 1500 bp؛ گزینهای کاربردی برای بسیاری از محصولات PCR.
1kb DNA Ladder
محدوده: 1000 تا 10000 bp
دارای 8 باند و باند مرجع 4000 bp؛ مناسب برای بررسی قطعات DNA در محدوده چند کیلوباز.
جدول انتخاب DNA Ladder یکتا تجهیز آزما
اگر هنوز در انتخاب لدر مناسب تردید دارید، از جدول زیر استفاده کنید:
| اگر اندازه DNA شما حدوداً… | انتخاب پیشنهادی |
|---|---|
| 50–500 bp | Eco 50bp DNA Ladder |
| 50–1000 bp | 50bp DNA Ladder |
| 100–1500 bp | 100bp DNA Ladder |
| 1–10 kb | 1kb DNA Ladder |
این جدول برای انتخاب اولیه بسیار کاربردی است؛ اما اگر اندازه محصول بین دو محدوده قرار دارد، بهتر است باندهای مرجع و فاصله باندهای هر Ladder را نیز بررسی کنید.
خرید DNA Ladder از یکتا تجهیز آزما
برای انتخاب DNA Ladder ابتدا اندازه تقریبی قطعه موردنظر خود را مشخص کنید و سپس بر اساس محدوده آن، محصول مناسب را انتخاب کنید.
اگر با قطعات کوچکتر در محدوده 50 تا 500 bp کار میکنید، Eco 50bp DNA Ladder گزینه مناسبی است. برای بازه گستردهتر تا 1000 bp میتوانید 50bp DNA Ladder را انتخاب کنید. برای بسیاری از محصولات PCR در محدوده 100 تا 1500 bp، 100bp DNA Ladder کاربرد دارد و برای قطعات چند کیلوبازی، 1kb DNA Ladder انتخاب مناسبتری است.
یکتا تجهیز آزما این محصولات را در دسته مواد مصرفی الکتروفورز عرضه میکند و علاوه بر DNA Ladder، محصولاتی مانند آگارز، Loading Dye و رنگهای مورد استفاده در مشاهده DNA نیز در این دسته قرار دارند.
سوالات متداول درباره DNA Ladder
DNA Ladder چیست؟
DNA Ladder مجموعهای از قطعات DNA با اندازههای مشخص است که در الکتروفورز بهعنوان استاندارد برای تخمین اندازه قطعات DNA نمونه استفاده میشود.
DNA Marker چیست؟
DNA Marker یا نشانگر DNA، استانداردی شامل قطعات DNA با اندازه مشخص است که برای مقایسه اندازه نمونههای ناشناخته در ژل استفاده میشود.
تفاوت DNA Ladder و DNA Marker چیست؟
در کاربردهای معمول آزمایشگاهی، DNA Ladder و DNA Marker اغلب برای اشاره به استاندارد اندازه DNA استفاده میشوند و تفاوت مفهومی مهمی در کاربرد روتین آنها وجود ندارد.
لدر 50bp برای چه قطعاتی مناسب است؟
لدر 50bp یکتا تجهیز آزما برای قطعات DNA در محدوده 50 تا 1000 bp طراحی شده و برای بررسی قطعات کوچک و محصولات PCR کاربرد دارد.
Eco 50bp DNA Ladder چیست؟
Eco 50bp DNA Ladder یک DNA Marker با 8 باند در محدوده 50 تا 500 bp است که برای بررسی قطعات کوچک DNA طراحی شده است.
تفاوت Eco 50bp و 50bp چیست؟
Eco 50bp محدوده 50 تا 500 bp را پوشش میدهد، در حالی که 50bp DNA Ladder یکتا تجهیز محدوده 50 تا 1000 bp را پوشش میدهد.
لدر 100bp برای چه قطعاتی مناسب است؟
لدر 100bp یکتا تجهیز برای قطعات 100 تا 1000 bp و یک باند 1500 bp طراحی شده است و برای بسیاری از محصولات PCR کاربرد دارد.
لدر 1kb چیست؟
1kb DNA Ladder مجموعهای از قطعات DNA با اندازههای کیلوبازی است. لدر 1kb یکتا تجهیز شامل قطعات 1000 تا 10000 bp است.
برای محصول PCR 500bp چه DNA Ladder انتخاب کنیم؟
برای محصول حدود 500 bp میتوان از Eco 50bp، 50bp یا 100bp DNA Ladder استفاده کرد. انتخاب دقیقتر به میزان تفکیک موردنیاز و محدوده اندازههای اطراف قطعه بستگی دارد.
برای محصول PCR حدود 1kb چه لدر انتخاب کنیم؟
برای محصول حدود 1kb، لدر 100bp و 1kb هر دو ممکن است قابل استفاده باشند؛ اما اگر هدف تفکیک دقیقتر در محدوده صدها جفتباز تا حدود 1.5 kb باشد، 100bp DNA Ladder انتخاب مناسبی است.
برای DNA بزرگتر از 2kb چه DNA Ladder مناسب است؟
برای قطعات چند کیلوبازی، 1kb DNA Ladder گزینه مناسبتری است؛ لدر 1kb یکتا تجهیز محدوده 1 تا 10 kb را پوشش میدهد.
آیا DNA Ladder برای تعیین غلظت DNA استفاده میشود؟
کاربرد اصلی DNA Ladder تعیین اندازه قطعات DNA است. برخی لدرها امکان تخمین تقریبی مقدار DNA را نیز فراهم میکنند، اما برای اندازهگیری دقیق غلظت باید از روش مناسب سنجش غلظت استفاده شود.
DNA Ladder در کدام چاهک ژل قرار میگیرد؟
DNA Ladder معمولاً در یک چاهک جداگانه در کنار نمونههای DNA قرار میگیرد تا باندهای نمونه با باندهای استاندارد مقایسه شوند.
جمعبندی
DNA Ladder چیست؟ DNA Ladder یک استاندارد اندازه مولکولی است که در الکتروفورز برای تخمین اندازه قطعات DNA استفاده میشود.
انتخاب DNA Ladder به اندازه قطعه موردنظر بستگی دارد. برای قطعات کوچک، Eco 50bp و 50bp DNA Ladder گزینههای مناسبی هستند. برای بسیاری از محصولات PCR در محدوده 100 تا 1500 bp، 100bp DNA Ladder کاربرد دارد و برای قطعات بزرگتر در محدوده چند کیلوباز، 1kb DNA Ladder انتخاب مناسبتری است.
بنابراین هنگام انتخاب DNA Ladder به جای اینکه صرفاً به نام 50bp، 100bp یا 1kb توجه کنید، ابتدا اندازه مورد انتظار DNA را مشخص کنید و سپس لدی را انتخاب کنید که باندهای آن بیشترین تطابق را با محدوده موردنظر شما داشته باشد.
