تفاوت‌های بین آب DEPC با آب های خالص

تفاوت‌های بین آب DEPC و آب فوق خالص و آب نوکلئاز فری

تعریف:

آب DEPC

یا آب دی‌اتیل‌پیروکربونات (DEPC) شده، به منظور حذف فعالیت‌های آنزیمی به ویژه RNAse ‌ها استفاده می‌شود.
واکنش های مولکولی DEPC با گروه‌های هیدروکسیل و آمین در RNAseها ، آن‌ها را به مولکول‌های غیر فعال تبدیل می‌کند.

پس از انجام واکنش با DEPC ، آب به مدت چند ساعت در دمای ۱۰۰ درجه سانتی‌گراد جوشانده می‌شود تا DEPC باقی‌مانده و محصولات جانبی حذف شوند.

• آب فوق خالص

  آب بسیار خالص است که به دقت از مواد آلی و معدنی، ذرات معلق، باکتری‌ها، و دیگر آلاینده‌ها تصفیه شده است. این نوع آب در آزمایش‌های حساس و دقیق نیازمند خلوص بالا استفاده می‌شود.

فرآیندهای مورد استفاده: شامل تقطیر چند مرحله‌ای، اسمز معکوس، یون‌زدایی، فیلتراسیون نانویی و اشعه‌ی UV برای حذف تمام آلاینده‌ها.

خلوص: آب فوق خالص به گونه‌ای تصفیه می‌شود که کمتر از ۱ میکروگرم آلاینده در لیتر داشته باشد. میزان خلوص آن با استفاده از مقاومت الکتریکی بالای ۱۸.۲ مگااهم سنجیده می‌شود.

• آب فوق خالص نوکلئاز فری یاUltra pure Nuclease-Free Water

  نوع خاصی از آب است که با فرآیندهای دقیق تصفیه شده تا تمامی آنزیم‌های نوکلئازی از آن حذف شود. این نوع آب برای تحقیقات زیست‌مولکولی و بیوتکنولوژی اهمیت زیادی دارد که دارای سه ویژگی مهم ذیل را است:

خلوص بالا: تمامی آنزیم‌های نوکلئاز شامل DNAse و RNAse از این آب حذف شده‌اند.

استریل بودن: معمولاً آب نوکلئاز فری برای جلوگیری از آلودگی‌های میکروبی، استریل می‌شود.

عدم وجود آلاینده‌ها: به‌طور کامل از هرگونه ترکیب شیمیایی آلاینده پاک شده است.

فرآیند تهیه:

• آب DEPC

  برای تهیه آب DEPC ، به هر لیتر آب، ۱ میلی‌لیتر DEPC افزوده و مخلوط به مدت ۳۰ دقیقه در دمای ۳۷ درجه سانتی‌گراد نگهداری می‌شود. سپس آب به مدت چند ساعت در دمای ۱۰۰ درجه سانتی‌گراد جوشانده می‌شود تا DEPC باقی‌مانده حذف شود.

• آب فوق خالص

  از فرآیندهای مختلفی مانند تقطیر، اسمز معکوس، و فیلتراسیون برای حذف تمام آلاینده‌ها استفاده می‌شود. این فرآیندها شامل مراحل متعددی هستند تا آب به درجه‌ای از خلوص برسد که هیچ ترکیب آلوده‌کننده‌ای باقی نماند.

• برای تهیه آب نوکلئاز فری

  از فیلترهای بسیار دقیق، دیالیز و فرآیندهای شیمیایی استفاده می‌شود. معمولاً این آب بعد از تصفیه از طریق اتوکلاو یا فیلتراسیون میکروبیولوژیک، استریل می‌شود.

کاربردها:

• آب DEPC :

تحقیقات RNA : برای جلوگیری از تخریب RNA توسط RNAse ها، در مراحل استخراج، تخلیص و ذخیره‌ RNA استفاده می‌شود.

آزمایش‌های PCR و RT-PCR : به عنوان یک محیط بدون RNAse برای اجرای دقیق و بدون تداخل این آزمایش‌ها.

• آب فوق خالص:

کاربردهای صنعتی: در تولید نیمه‌هادی‌ها، ساخت داروها و تولید محصولات شیمیایی حساس به خلوص آب.

آزمایش‌های تحلیلی: مانند HPLC (کروماتوگرافی مایع با کارایی بالا) و ICP-MS (طیف‌سنجی جرمی پلاسما جفت شده القایی) که نیازمند آب با خلوص بسیار بالا هستند.

• آب فوق خالص نوکلئاز فری:

          تحقیقات RNA و DNA : به منظور استخراج، تخلیص و ذخیره RNA و DNA مورد استفاده قرار می گیرد. زیرا حضور نوکلئازها باعث تخریب این اسیدهای نوکلئیک شود.

         آزمایش‌های PCR و RT-PCR : در این آزمایش‌ها نیاز به محیط بدون نوکلئاز است تا دقت و صحت نتایج تضمین شود.

         ساخت محلول‌ها و واکنش‌ها: تهیه محیط‌ها و محلول‌های آزمایشگاهی که حساس به حضور نوکلئازها هستند.

مزایا:

• آب DEPC

  • مزایا: حذف کامل RNAse ها، جلوگیری از تخریب RNA، کاربرد ویژه در تحقیقات مولکولی.
  • معایب: نیاز به جوشاندن طولانی برای حذف DEPC باقی‌مانده.

• آب فوق خالص

  • مزایا: خلوص بسیار بالا، مناسب برای گستره وسیعی از کاربردهای صنعتی و آزمایشگاهی.
  • معایب: فرآیندهای پیچیده و گران‌قیمت برای تهیه.

• آب فوق خالص نوکلئاز فری:

مزایا :حفظ نمونه‌های بیولوژیکی: عدم وجود نوکلئازها از تخریب نمونه‌ها جلوگیری می‌کند.

استفاده گسترده در تحقیقات: برای بسیاری از واکنش‌های زیست‌مولکولی که نیاز به محیط بدون نوکلئاز دارند، ضروری است.

• معایب: فرآیندهای گران‌قیمت برای تهیه.

نتیجه‌گیری:

هر سه نوع آب اهمیت زیادی در زمینه‌های خاص خود دارند. آب DEPC برای حذف RNAseها و جلوگیری از تخریب RNA در تحقیقات مولکولی استفاده می‌شود. آب فوق خالص به دلیل خلوص بسیار بالا در آزمایش‌های دقیق و کاربردهای صنعتی حساس به خلوص آب به کار می‌رود. انتخاب بین این دو نوع آب باید بر اساس نیازهای خاص و محیط کاری انجام شود.

آب فوق خالص نوکلئاز فری یا Ultra pure Nuclease-Free Water نوعی آب است که با فرآیندهای دقیق تصفیه شده تا تمامی آنزیم‌های نوکلئازی از آن حذف شود. این آب در تحقیقات زیست‌مولکولی و بیوتکنولوژی اهمیت زیادی دارد.

آب نوکلئاز فری با تضمین عدم حضور آنزیم‌های نوکلئازی به حفظ نمونه‌های بیولوژیکی و صحت نتایج آزمایش‌ها کمک می‌کند. انتخاب و استفاده دقیق از این نوع آب، کارایی و دقت در آزمایش‌های زیست‌مولکولی را بهبود می‌بخشد.