توضیحات
YTA Loading Dye یک ماده رنگی می باشد که برای آماده سازی و بارگزاری (load) نمونه های DNA روی ژل های آگارز یا پلی آکریل آمید استفاده می شود. رنگ استفاده شده در Loading Dye می تواند بروموفنول بلو ، زایلن سیانول ، اورنج جی ، کرسول رد و … باشد. هر یک از این مواد ، رنگ متفاوتی ایجاد می کنند. همچنین در حین ران شدن ژل الکتروفورز، هریک از این رنگ ها هم ردیف سایز مشخصی از DNA قرار می گیرند. برای مثال بروموفنول بلو در ژل آگارز 0.8% به موازات 100-300 جفت باز قرار می گیرد و در ژل 2% به موازات 150 جفت باز. بنابراین ، این رنگ جلوتر از باند DNA روی ژل حرکت می کند و بدین ترتیب می توان حرکت DNA در طول ژل را به دقت بررسی کرد. رنگ انتخاب شده نباید واکنشی باشد و یا ساختار DNA را تغییر دهد. رنگ های بروموفنول بلو و زایلن سیانول در YTA Loading Dye استفاده شده اند. بروموفنول بلو رنگی است که برای ردیابی رشته های DNA با ابعاد کوچکتر حاوی حدود 400-300 جفت باز استفاده می شود ، در حالی که زایلن سیانول برای رشته های DNA بزرگتر با حداکثر 8000 جفت باز بهتر عمل می کند.
نقش و کاربرد YTA Loading Dye به طور خلاصه به شرح زیر می باشد:
- این محصول به عنوان یک شاخص رنگی جهت دنبال کردن حرکت DNA در ژل الکتروفورز استفاده می شود. با توجه به بی رنگ بودن DNA، نیازمند ماده ای رنگی هستیم که ، جلوتر از DNA حرکت کند تا متوجه جایگاه DNA در ژل ، حین الکتروفورز باشیم.
- چگالی DNA کمتر از رانینگ بافر می باشد. در نتیجه اگر DNA را به اتنهای چاهک های ژلی که درون رانینگ بافر قرار گرفته است لود کنیم ،DNA ، داخل بافر پخش می شود. Loading Dye حاوی گلیسرول و یا فیکول است که با بالا بردن چگالی نمونه های DNA ، سبب باقی ماندن آن ها در انتهای چاهک های ژل می شود.
